Al principi els religiosos carmelites van habitar en el que després va ser hospital de Sant Llàtzer, al carrer Alboraia , fora dels murs de la ciutat de València . Iñigo Blasco posseïa una casa i un hort al barri dels Roters que el va donar al religiós carmelita Arnau de Bascher , el 14 novembre 1281 perquè es fundés un convent del seu orde , però donades les seves petites dimensions van haver d’adquirir dues hortes confrontants per poder fer realitat el projecte proposat . Concloses les obres, el 14 octubre 1343 , es va consagrar l’altar dedicat a la Mare de Déu del Carme per Jaume Figo , bisbe de Lleida , per delegació del bisbe diocesà , Ramon Gastón .
En 1367 es va ampliar la primitiva obra , mitjançant privilegi concedit pel rei Pere II , que va atorgar als escrivans de València la gràcia que es reunissin en aquest convent el 18 d’octubre, festa de Sant Lluc . Posteriorment , es van anar donant diverses millores i ampliacions que van anaren determinant la varietat de estils arquitectònics . D’aquesta manera, la capçalera va ser reformada el 1555 , emprant el sistema constructiu tradicional de volta de crueueria estavellada , actualitzat amb detalls ornamentals de gust renaixentista . En 1656 es va renovar l’Església , mitjançant un ordenament classicista , adquirint amb aquest fi algunes cases adjacents .
Del seu passat medieval es conserva encara un claustre gòtic d’arcs apuntats , el gran refetor o menjador de la comunitat i la sala capitular . Es va construir posteriorment un segon claustre renaixentista , en què els elements més visibles corresponen ja a l’època barroca .
En aquesta església hi havia un altar dedicat a Sant Roc, al qual el poble cristià professava una gran devoció , en experimentar la seva protecció en una epidèmia que va assolar València en 1489 .
En 1613 es va construir a la part de l’epístola la capella de la Comunió , obra del religiós Gaspar de Sant Martí ( 1574-1644 ) . Actualment està coberta amb volta de canó , lluneta i cúpula .
A la capella al costat del Altar Major es troba el sepulcre del venerable Joan Sanz (1557-1608) , natural d’Ontinyent , religiós exemplar d’aquest convent , mestre de la vida espiritual i autor de diversos tractats místics que va morir amb fama de santedat el 25 de juny de 1608 .