Bioinformatica i codi obert

Al mati hem tingut una xerrada sobre Bioinformatica, que el ponent, Oscar Conchillo, ha definit com una "branca de la bioquimica", donant a entendre que no es nomes purament una eina tecnologica asociada al creixent mon de la genomica i la proteomica, si no que tambe implica contribucions a la biologia teorica.

Conchillo ens ha explicat com un laboratori de bioinformatica que
hagues implicat utilitzant una plataforma propietaria una inversio
millionaria dificilment asumible, al fer-ho amb gnu/linux s’ha reduit
considerablement els costos. Per fer entenedor que es fa en
bioinformatica, el ponent ens ha ensenyat diferent programari(dient en
cada cas si era lliure o no), p.ex. software que permet comparar les
estructures tridimensionals de les proteines, o diferents sequencies
genetiques. En el cas de les sequencies genetiques, per veure p.ex.
quan d’evolutivament estem aprop dels gens d’un porc, una rata o una
vaca.
Finalment ens ha ensenyat un aplicatiu sota llicencia GPL que han
desenvolupat l’equip del que forma part, si no he entes malament,

De les preguntes del public ha sorgit la proposta de documentar tota
l’experiencia del ponent i el seu equip, de crear un laboratori de
bioinformatica utilitzant  software lliure, perque sens dubte pot ser
de moltissim interes per a altres investigadors. Des d’aquest weblog,
animem a l’Oscar a donar aquest pas en un futur proper.

Tambe s’ha comentat la gran necessitat de comput d’aquesta disciplina, una simple simulacio d’uns pocs picosegons requereix molts cicles de computacio.

Lluis Guiu

Afegeix un comentari

Deixa un comentari

L'adreça electrònica no es publicarà. Els camps necessaris estan marcats amb *